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《利用Python进行数据分析·第2版》第四章 Numpy基础:数组和矢

发布时间:2020-12-20 10:23:19 所属栏目:Python 来源:网络整理
导读:《利用Python进行数据分析·第2版》第四章 Numpy基础:数组和矢量计算 numpy高效处理大数组的数据原因: numpy是在一个连续的内存块中存储数据,独立于其他python内置对象。其C语言编写的算法库可以操作内存而不必进行其他工作。比起内置序列,使用的内存更

《利用Python进行数据分析·第2版》第四章 Numpy基础:数组和矢量计算

numpy高效处理大数组的数据原因:

  • numpy是在一个连续的内存块中存储数据,独立于其他python内置对象。其C语言编写的算法库可以操作内存而不必进行其他工作。比起内置序列,使用的内存更少(即时间更快,空间更少)

  • numpy可以在整个数组上执行复杂的计算,而不需要借助python的for循环

4.0 前提知识

数据:结构化的数据代指所有的通用数据,如表格型,多维数组,关键列,时间序列等
相关包:numpy pandas matplotlib scipy scikit-learn statsmodels

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import seaborn as sns
import statsmodels as sm

数据规整(Munge/Munging/Wrangling):
指的是将非结构化和(或)散乱数据处理为结构化或整洁形式的整个过程。这几个词已经悄悄成为当今数据黑客们的行话了。Munge这个词跟Lunge押韵。

伪码(Pseudocode):
算法或过程的“代码式”描述,而这些代码本身并不是实际有效的源代码。

语法糖(Syntactic sugar):
这是一种编程语法,它并不会带来新的特性,但却能使代码更易读、更易写。

4.1 Numpy的ndarrray:一种多维数组对象

ndarray:N维数组对象,快速而灵活的大数据集容器

  • 通用的同构数据多维容器(所有元素相同类型)
  • 每个对象都有一个shape(表示各维度大小的元组)+dtype(表示数组数据类型的对象)+ ndim(维度)

对整块数据执行运算的语法=标量元素执行运算的语法

np.random.randn(n,m):生成2行3列的正态分布随机数组

data = np.random.randn(2,3)
array([[-0.2047,0.4789,-0.5194],[-0.5557,1.9658,1.3934]])

data * 10
array([[ -2.0471,4.7894,-5.1944],[ -5.5573,19.6578,13.9341]])

In [17]: data.shape
Out[17]: (2,3)
In [18]: data.dtype
Out[18]: dtype('float64')

1)创建ndarray

np.array(一切对象)—>自动推断数据类型

np.zeros((n,m)) / np.ones((n,m)) / np.empty((n,m)):生成全0,全1,全未初始化垃圾值数组,传入元组/整数

np.arange():range函数的numpy版本 如果没有特别指定,数据类型基本都是float64(浮点数)

2)ndarray的数据类型

dtype是一个特殊的对象:含有ndarray将一块内存解释为特定数据类型所需的信息
—>命名方式:类型名+元素位长(float8字节64位长)


numpy会将 Python类型映射到等价的dtype上(如误写float映射为np.float64)
npo:在此简写为np类型的对象
npo.astype():np强制类型转换

3)Numpy数组的运算

矢量化(vectorization):大小相等的数组之间任何运算均应用到元素级

数组与标量的算术运算会将标量值广播到各个元素

大小相同的数组之间比较会生成布尔数组(逻辑运算)

4)基本的索引和切片

一维数组:
标量赋值切片时,标量值自动广播

数组切片是原始数组的视图,不同于python内置列表,切片上的修改会映射到源数组上
(内置列表的切片是新建一个列表不会改变源列表)——>一种是视图,另一种是副本:副本用npo.copy()

二维数组:
npo[0,2] —> 表示第一行第三列的数
npo[[0,1],2] —> 表示第一二行第三列的数

5)切片索引

一维数组同python列表
二维数组npo[n],n表示行;npo[:n],则表示取数组前n行;npo[:2,1:],表示取前两行,除第一列外的元素数组

6)布尔型索引

一维布尔型数组可用于数组索引:一维布尔型数组长度==索引数组的行长度(轴长度) —>用于筛选
二维则需要大小相同才可做索引运算

比较运算(组合逻辑)得到布尔型索引—>比较运算可以用!= / 也可以用~()对条件进行否定
(用来反转条件好用)

布尔型数组中用 & 和 | ,而不用and or —>数据运算得到的布尔型索引数组是新数组

print(data)
print(data[names == 'tom',1:])  

[[ 0.16915065  0.15038684  0.34028728]  
[ 0.32732646  0.69241855  0.65203056]  
[ 0.84402175  0.77184234  0.48730057]  
[ 0.94376757  0.33876278  0.77287885]  
[ 0.58535219  0.50321862  0.28196336]]  

[[ 0.15038684  0.34028728]  
[ 0.50321862  0.28196336]]

(注意: 原书中翻译“通过布尔型索引选取数组中的数据,将总是创建数据的副本,即使返回一模一样的数组也是如此。”<该处翻译可能有误>,因为如下)

In [113]: data[data < 0] = 0
In [114]: data
Out[114]:
array([[ 0.0929,0.2817,0.769,1.2464],[ 1.0072,0.,0.275,0.2289],[ 1.3529,0.8864,0. ],[ 1.669,0.477 ],[ 3.2489,0.1241],[ 0.3026,0.5238,0.0009,1.3438],[ 0.,0. ]])

可以通过布尔索引对数组进行赋值,证明布尔索引得到的数据是视图而非副本

7)花式索引

numpy术语,利用整数数组进行索引

In [119]: arr
Out[119]:
array([[ 0.,0.],[ 1.,1.,1.],[ 2.,2.,2.],[ 3.,3.,3.],[ 4.,4.,4.],[ 5.,5.,5.],[ 6.,6.,6.],[ 7.,7.,7.]])
In [120]: arr[[4,3,6]]
Out[120]:
array([[ 4.,6.]])

花式索引在选择索引行、列上使用频繁(1.一个[]就是一个维度,逗号分割维度 2.按照[]内顺序进行筛选
负数索引从末尾开始选取行

npo[[行],[:,列]],扩展同理(后面格式必须得这样,否则会出现预期不一样的结果

array([[ 0,1,2,3],[ 4,5,6,7],[ 8,9,10,11],[12,13,14,15],[16,17,18,19],[20,21,22,23],[24,25,26,27],[28,29,30,31]])
In [124]: arr[[1,7,2],[0,2]]        #这种格式相当于是[1,0],[5,3]....
Out[124]: array([ 4,23,10])
In [125]: arr[[1,2]][:,2]]        #这种格式才是预期的结果,把第一行的第0,2列都拿出来,再是第五行的....
Out[125]:
array([[ 4,6],22],31,30],11,10]])

花式索引!=切片,花式索引是副本而非视图

8)数组转置和轴对换

npo.T属性:数组的转置数组(方法一:针对一二维数组:返回视图非副本
npo.transpose(arry_method)(方法二:针对高维数组:返回视图非副本 arry_method:由轴编号组成的元组 / 轴就是维度
transpose方法结合npo.shape进行 —>

In [60]: arr1 
Out[60]: array([[[ 0,[ 3,4,5]],[[ 6,8],[ 9,11]]]) 
In [61]: arr1.shape #看形状 
Out[61]: (2,3) #说明这是一个2*2*3的数组(矩阵),返回的是一个元组,可以对元组进行索引,也就是0,2,维度进行编号

In [134]: arr.transpose((1,2))    #这里的(1,2)元组就相当是维度元组(0,2) 说明把第三维和第二维进行了交换(一般而言保持第一维度不会变化
Out[134]:
array([[[ 0,#比如数值6,原本是(1,0)的位置,变换后是(0,0)
[ 8,11]],[[ 4,15]]])

np.dot():计算矩阵内积 —>np.dot(npo.T,npo)
npo.swapaxes(arry_method)(方法三:实现两个维度的交换:返回视图非副本 arry_method:接受一对轴编号 / 就是两个维度

转置和轴对换

4.2 通用函数:快速的元素级数组函数 ufunc

简单函数(接受一个或多个标量值,并产生一个或多个标量值)的矢量化包装器。

一元ufunc(接受一个矢量):np.sqrt np.exp... 一元:unary
二元ufunc: np.add() np.maximum... 二元:binary
返回多个数组:np.modf(内置函数divmod的矢量化版本:divmod(a,b) / 返回一个包含shan商和余数的元组(a//b,a%b)
//更确切说是math库中modf的矢量化版本:将数组各元素的小数部分和整数部分以两个独立数组形式返回

ufunc可接受一个out可选参数:表示在传入数组上原地进行操作(即结果值返回至数组中
部分一元、二元ufunc




4.3利用数组进行数据处理

np.meshgrid():生成网格点坐标矩阵 //强烈的规律性快速生成矩阵

图中每个交叉点都是网格点;网格点的坐标的矩阵就是坐标矩阵

xs,ys = np.meshgrid(points,points)

传入参数为两个一维数组,分别是所有的x、y值
返回产生的两个二维数组,分别是按网格状化后排列的x、y值

numpy.meshgrid()理解

1)将条件逻辑表述为数组运算

np.where():三元表达式 x if condition else y 的矢量化版本
条件:布尔矩阵 if:第二个参数 else:第三个参数 返回:产生的新数组

In [165]: xarr = np.array([1.1,1.2,1.3,1.4,1.5])
In [166]: yarr = np.array([2.1,2.2,2.3,2.4,2.5])
In [167]: cond = np.array([True,False,True,False])    #cond为True时,选取xarr的值,否则从yarr中选取。
In [168]: result = [(x if c else y)                #列表生成式写法
.....: for x,y,c in zip(xarr,yarr,cond)]
In [169]: result
Out[169]: [1.1000000000000001,2.2000000000000002,1.3999999999999999,2.5]    #1.大数据处理慢  2.无法用于多维数组(多个for时间度问题

In [170]: result = np.where(cond,xarr,yarr)        #np.where解决
In [171]: result
Out[171]: array([ 1.1,2.5])

np.where作用:根据另一个数组而产生一个新数组;
第二三个参数不一定是矢量,也可以是标量

In [173]: arr
Out[173]:
array([[-0.5031,-0.6223,-0.9212,-0.7262],[ 0.2229,0.0513,-1.1577,0.8167],[ 0.4336,1.0107,1.8249,-0.9975],[ 0.8506,-0.1316,0.9124,0.1882]])
In [174]: arr > 0
Out[174]:
array([[False,False],[ True,True],True]],dtype=bool)
In [175]: np.where(arr > 0,-2)
Out[175]:
array([[-2,-2,-2],[ 2,2]])

2)数学和统计方法

聚合计算:(aggregation,通常叫约简(reduction)) 聚类统计

np.sum np.mean np.std... 求和平均标准差 可以对整个数组 / 也可以接受一个axis计算对某轴的统计值
axis=1(行) axis=0(列)

非聚合计算:np.cumsum np.cumprod... 累加累乘 产生一个结果数组(多维数组中一样,可以指定轴)


3)用于布尔型数组的方法

布尔型数组也可用于统计方法—>转为1 / 0

(sum求True个数
(any是否存在True (all是否都是True 同样适用于数值数组

4)排序

npo.sort():原地排序 (多维数组加axis

np.sort返回副本,npo.sort原地修改本身

计算数组分位数:1.排序 2.选取特定位置值

In [203]: large_arr = np.random.randn(1000)
In [204]: large_arr.sort()
In [205]: large_arr[int(0.05 * len(large_arr))] # 5% quantile
Out[205]: -1.5311513550102103

其他排序:附录+pandas

5)唯一化以及其他的集合逻辑

集合函数

np.unique():找出数组中唯一值并返回排序结果 = set+sorted
np.in1d():试探一个数组的值在另一个数组中的成员是否包含,返回布尔型数组

4.4 用于数组的文件输入输出(较为简单的fIO)

np.save:数组以未压缩的原始二进制格式 扩展名:.npy
np.savez:多个数组保存到一个未压缩文件中,数组以关键字参数形式传入 扩展名:.npz
np.load:加载.npy正常 加载.npz时得到类似字典的对象:对各个数组进行延迟加载(类似迭代器,惰性计算
np.savez_compressed:数据压缩

4.5线性代数

x.dot(y) = np.dot(x,y) :矩阵乘法 所有数组dot方法和np命名空间函数的区别是:dot方法是视图,函数是副本

@符(类似python3.5)也可以作为中缀运算符进行矩阵乘法:

In [230]: x @ np.ones(3)
Out[230]: array([ 6.,15.])

numpy.linalg中有一组标准的矩阵分解运算以及如求逆和行列式等:
In [231]: from numpy.linalg import inv,qr In [232]: X = np.random.randn(5,5) In [233]: mat = X.T.dot(X) In [234]: inv(mat) Out[234]: array([[ 933.1189,871.8258,-1417.6902,-1460.4005,1782.1391],[ 871.8258,815.3929,-1325.9965,-1365.9242,1666.9347],[-1417.6902,2158.4424,2222.0191,-2711.6822],[-1460.4005,2289.0575,-2793.422 ],[ 1782.1391,1666.9347,-2711.6822,-2793.422,3409.5128]]) In [235]: mat.dot(inv(mat)) #求逆 Out[235]: array([[ 1.,-0.,-0.],[-0.,1.]]) In [236]: q,r = qr(mat) #qr矩阵分解 In [237]: r Out[237]: array([[-1.6914,4.38,0.1757,0.4075,-0.7838],-2.6436,0.1939,-3.072,-1.0702],-0.8138,1.5414,0.6155],-2.6445,-2.1669],0.0002]])

4.6 伪随机数生成

np.random.normal:标准正态分布
np.random.seed:设置随机数生成种子(全局状态种子
np.random.RandomState:创建一个与其他隔离的随机数生成器(局部状态种子)


4.7 示例:随机漫步

纯python:

In [247]: import random
.....: position = 0
.....: walk = [position]
.....: steps = 1000
.....: for i in range(steps):
.....: step = 1 if random.randint(0,1) else -1
.....: position += step
.....: walk.append(position)
.....:

转为numpy:

In [251]: nsteps = 1000
In [252]: draws = np.random.randint(0,size=nsteps)    #size决定是一维的
In [253]: steps = np.where(draws > 0,-1)
In [254]: walk = steps.cumsum()

In [249]: plt.plot(walk[:100])        #x步数也就是时间,y是离初始点的距离

对l累加后的漫步数据一些统计计算处理:

In [255]: walk.min()
Out[255]: -3
In [256]: walk.max()
Out[256]: 31

假设离初始点距离10步外就是穿越过了漫步地点,想要知道首次穿越时间:

In [257]: (np.abs(walk) >= 10).argmax()    #argmax返回数组最大值的第一个索引位置
Out[257]: 37                    #所以第37步时第一次走出漫步地点

一次性模拟多个随机漫步:

In [258]: nwalks = 5000
In [259]: nsteps = 1000
In [260]: draws = np.random.randint(0,size=(nwalks,nsteps)) # 0 or 1    #size决定是二维的 行:第几次walk 列:nwalk的第几步
In [261]: steps = np.where(draws > 0,-1)
In [262]: walks = steps.cumsum(1)        #按行作累加 / 非聚合
In [263]: walks
Out[263]:
array([[ 1,...,8,[ 1,-1,34,33,32],4],24,26],14],[ -1,-3,-24,-23,-22]])

计算所有随机漫步的统计数据:

In [264]: walks.max()        
Out[264]: 138
In [265]: walks.min()
Out[265]: -133

之后计算每个随机漫步的首次穿越时间:阈值=30(注:不是每次漫步都能够穿越,所以需要清理检查

In [266]: hits30 = (np.abs(walks) >= 30).any(1)        #按行筛选每行是不是有abs>30的值
In [267]: hits30
Out[267]: array([False,dtype=bool)
In [268]: hits30.sum() # Number that hit 30 or -30        #为True的就是满足要求的,一共有3410个
Out[268]: 3410

获取穿越时间:

In [269]: crossing_times = (np.abs(walks[hits30]) >= 30).argmax(1)    #花式索引筛选满足要求行+argmax找到首次穿越的时间
In [270]: crossing_times.mean()
Out[270]: 498.88973607038122

(编辑:李大同)

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