从Postgresql表中绘制表和关系

对的,这是可能的.

至于如何实现,请参阅以下步骤

脚步

>连接到PostgreSQL数据库
>获取数据库的架构信息
>将架构信息存储在数据结构中/将数据帧中的数据重新排列为数据结构.
>从数据结构生成图表

步骤1

对于从R连接到PostgreSQL数据库,有各种机制,包括

> RPostgreSQL(R到PostgreSQL,持久连接)
> sqldf(R到PostgreSQL,临时连接自动执行第3步的一部分),它有RPostgreSQL作为依赖.
> PL/R(PostgreSQL到R)
> db.r(R到PostgreSQL,具有内置的基本数据库可视化,例如部分步骤2,3,4,)

RPostgreSQL中的步骤1的示例如下：

library(RPostgreSQL)

## loads the PostgreSQL driver
drv <- dbDriver("PostgreSQL")

## Open a connection
con <- dbConnect(drv,dbname="databasename")

第2步

这可以通过几种方式完成.它可以直接在SQL中完成,也可以使用

RPostgreSQL的dbListTables和dbListFields或两者的组合.

例如,SQL用于查询数据库中的所有表,或表中的所有字段/列或表中的所有约束,请参阅以下StackOverflow答案

> PostgreSQL Describe Table
> Show tables in PostgreSQL
> List all tables in PostgreSQL information schema
> How do I list all columns for specified table DBA StackExchange
> PostgreSQL to list foreign keys(您只需从where子句中删除或修改约束类型以获取外键和主键)

总之,您只需查询information_schema.tables,information_schema.columns和information_schema.table_constraints即可获得所需信息.如果速度是一个问题(在上面的链接答案中提到它们),您可以使用PostgreSQL特定表而不是ANSI SQL标准表,但它们可能会随时间而变化.

这里的步骤是

>获取表格列表
>遍历表列表并获取每个表的列(或者只是查询包含结果集中表名和列名的查询的所有列)
>遍历表列表并交替获取每个表的约束,只查询包含结果集中表名和约束名的查询的所有列

RPostgreSQL中的步骤2的示例如下：

调整您的SQL以适应.

第1部分

获取表格列表

使用内置功能

tables1 <- dbListTables(con)

使用SQL

tables2 <- dbGetQuery(con,"select table_name from information_schema.tables")

第2部分

使用内置功能

您将使用dbListFields(con,“TableName”),并应用于表的先前数据帧.请参见how to apply a function to every row of a matrix (or a data frame) in R或Apply a function to each row in a data frame in R并将结果保存到变量.

使用SQL

columns2 <- dbGetQuery(con,"select table_name,column_name from information_schema.columns")

第3部分

使用SQL

constraints <- dbGetQuery(con,constraint_name,constraint_type from information_schema.table_constraints")

第3步

从第2步开始,您应该有表列表,表列表及其关联的字段/列,表列表及其相关约束.

您需要输出要使用的CityPlot的csv文件,或GraphViz的点文件,或者igraph的图形格式或数据框或hash,以便使用使用网格或图表绘制表格和连接的函数进行处理.

如果要将它们组合到单个数据帧中,则子集和合并将非常有用.

第4步

该步骤也可以以许多不同方式完成.这些包括但不限于

> grid-package(参见参考文献中的pdf,例如与您请求的用例匹配的文章),低级图形基元
> diagram package和shape package(参见参考资料中的pdf用法示例)略高级别的图形基元
> Rgraphviz package(Graphviz,基本上要么生成点文件步骤3,要么参阅参考文献中的pdf以获取更多信息)
> igraph package(仅为每列和表组合生成扁平圆圈)
> CityPlot package(生成实体关系图而不是数据库表图,但可能满足您的需求,需要步骤3从数据框生成csv文件)

如果使用图表,形状或网格包,您将迭代表列表,或散列或其他数据结构,并在每个表上应用绘图函数,然后有一个单独的函数,应用于每个约束绘制线条.

参考

> R an PostgreSQL using RPostgreSQL and sqldf
> Youtube video Example: PostgreSQL Connection to R
> Drawing Diagrams with R
> R Package diagram: visualising simple graphs,flowcharts,and webs
> Example RPostgreSQL usage
> Dot Guide For Graphviz
> How To Plot A Graph Using Rgraphviz