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基因数据处理5之GRCH38数据源和查看信息
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：168
数据源： ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA_000001405.15_GRCh38/seqs_for_alignment_pipelines.ucsc_ids/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna.gz 可以用ftp或者wget 解压： gzip -d GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna.g[详细]
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2016年算法之大数乘法
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：115
#include iostream#include cstring#include stdio.husing namespace std;int main(){ string s1,s2; cins1s2; int len1=s1.length(); int len2=s2.length(); int len=len1+len2; int a[len1],b[len2]; int c[len]; int k=len1,kk=len2; for(int i=0;ilen1;i[详细]
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大数相关计算(c语言版)
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：91
语法：int result=factorial(int n);参数：n： n 的阶乘返回值： 阶乘结果的位数注意： 本程序直接输出n!的结果，需要返回结果请保留long a[] 需要 math.h源程序： int factorial(int n){long a[10000];int i,j,l,c,m=0,w; a[0]=1; for(i=1;i=n;i++) { c=0;[详细]
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两位数的大数乘法
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：125
# include iostream # include cstdio # include cstring # include algorithm using namespace std ; int main(){ int a[ 30 ],b[ 30 ]; int result[ 30 ]; char st1[ 30 ],st2[ 30 ]; scanf ( "%s%s" ,st1,st2); int len1,len2; len1 = strlen (st1); len2[详细]
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基因数据处理6之BWA_MEM无法分配内存
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：159
基因数据处理之BWA_MEM无法分配内存： ? ? ?建立BWA索引的时候内存不足，现在用BWA-MEM又内存不足，真耗内存 hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/data_HDFS/GRCH38/GCA_000001405.15_GRCh38/test20160310$ bwa mem GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_00000140[详细]
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2016蓝桥杯算法提高——P1001（大数乘法）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：60
算法提高 ? P1001（大数乘法） 当两个比较大的整数相乘时，可能会出现数据溢出的情形。为避免溢出，可以采用字符串的方法来实现两个大数之间的乘法。具体来说，首先以字符串的形式输入两个整数，每个整数的长度不会超过8位，然后把它们相乘的结果存储在另一[详细]
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流式大数据处理的三种框架：Storm，Spark和Samza
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：202
许多分布式计算系统都可以实时或接近实时地处理大数据流。本文将对三种Apache框架分别进行简单介绍，然后尝试快速、高度概述其异同。 Apache Storm 在Storm中，先要设计一个用于实时计算的图状结构，我们称之为拓扑（topology）。这个拓扑将会被提交给集群，[详细]
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流数据处理设计模式
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：189
push,stream-based,事件驱动。代表SAX(JSR 5) pull,事件驱动。代表StAX,Jackson,opencsv 游标模式 ? 输入 输出 StAX(JSR?173) javax.xml.stream.XML Stream Reader l ? 获取游标当前的数据： int?getEventType(),?getXXX(),?hasXXX(),?isXXX() l ? 移动游标[详细]
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梅森素数（再续大数处理）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：166
? 题目要求： ? 标题: 梅森素数 ? ? 如果一个数字的所有真因子之和等于自身，则称它为“完全数”或“完美数” ? ? 例如：6 = 1 + 2 + 3 ? ? 28 = 1 + 2 + 4 + 7 + 14 ? ? 早在公元前300多年，欧几里得就给出了判定完全数的定理： ? ? 若 2^n - 1 是素数，则[详细]
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大数据如何驱动产品和运营？数据处理流程、分析方法和实战案例
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：52
一 大数据思维 在2011年、2012年大数据概念火了之后，可以说这几年许多传统企业也好，互联网企业也好，都把自己的业务给大数据靠一靠，并且提的比较多的大数据思维。 那么大数据思维是怎么回事？我们来看两个例子： 案例1：输入法 首先，我们来看一下输入法[详细]
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基因数据处理7之BWA_MEM运行太长
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：126
基因数据处理7之BWA_MEM运行太长 hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$ bwa mem GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna SRR003161.fastq SRR003161b.sam[M::bwa_idx_load_from_disk] read 261 ALT contigs[[详细]
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基因数据处理8之BWA_MEM小数据集处理（成功）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：193
基因数据处理8之BWA_MEM小数据集处理 环境：ubuntu14.04 6G内存 参考基因：GRCH38 来源请参考【1】 1. fastq数据： SRR003161.fastq 的头20行，即5条reads 操作记录： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$ cat SRR003161.fastq |head -20 SR[详细]
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基因数据处理9之BWA小数据集测试（成功）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：92
基因数据处理9之BWA小数据集测试（成功） 1.fastq为20条，即reads为5条： hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/data_HDFS/GRCH38/GCA_000001405.15_GRCh38/test20160310$ cat SRR003161.fastq |head -20 SRR003161h20.fastqhadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/x[详细]
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HDU——1042N！（大数阶乘乘法）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：177
N! Time Limit: 10000/5000 MS (Java/Others)????Memory Limit: 262144/262144 K (Java/Others) Total Submission(s): 70861????Accepted Submission(s): 20321 Problem Description Given an integer N(0 ≤ N ≤ 10000),your task is to calculate N! ? ?[详细]
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基因数据处理10之BWA处理速度太慢
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：144
基因数据处理10之BWA处理速度太慢： hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/data_HDFS/GRCH38/GCA_000001405.15_GRCh38/test20160310$ bwa aln GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna SRR003161.fastq SRR003161.sai[bwa_[详细]
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机器学习中的相似性
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：94
机器学习中的相似性 本文转载自http://blog.csdn.net/pi9nc/article/details/9068359 在做分类时常常需要估算不同样本之间的相似性度量(Similarity Measurement)，这时通常采用的方法就是计算样本间的“距离”(Distance)。采用什么样的方法计算距离是很讲究[详细]
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基因数据处理11之sam文件格式
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：75
基因数据处理11之sam文件格式 SAM的全称是sequence alignment map format。而BAM就是SAM的二进制文件(B取自binary) 1. read名称 2. SAM标记 3. chromosome 4. 5′端起始位置 5. MAPQ（mapping quality，描述比对的质量，数字越大，特异性越高） 6. CIGAR字串[详细]
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基因数据处理12之samtool的tview来查看sam的匹配文件
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：165
基因数据处理12之samtool的tview来查看sam的匹配文件 具体的之前有文章讲过：http://blog.csdn.net/xubo245/article/details/50836185 记录： 1. 运行 ?samtools tview SRR003161h20Sorted.bam GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analys[详细]
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大数加法
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：88
思想 ：用数组来代替基本类型 来实现大数加法 代码实现 // main.c // 大数加法 // // Created by devilthrone on 16/3/13. // Copyright (c) 2016年 devilthrone. All rights reserved. // #include stdio.h void add( char a[], char b[], char d[]) { char[详细]
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基因数据处理13之bwa处理SRR003161
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：169
基因数据处理13之bwa处理SRR003161 hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$ bwa aln GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna SRR003161.fastq SRR003161.sai[bwa_aln] 17bp reads: max_diff = 2[bwa_aln] 38bp[详细]
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基因数据处理14之BWA三种方式bwa、BWA_SW、BWA_MEM使用
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：72
1.构建索引： bwa index ref.fa 或者从ftp下载，请参考【1】 2.BWA： bwa.sh为脚本文件 hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/bwa3sh$ cat bwa.sh #!/bin/bashbwa aln ../GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.[详细]
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【算法训练】区间k大数查询
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：147
? 算法训练 区间k大数查询 ? 时间限制：1.0s ? 内存限制：256.0MB ??? ??? 问题描述 给定一个序列，每次询问序列中第l个数到第r个数中第K大的数是哪个。 输入格式 第一行包含一个数n，表示序列长度。 第二行包含n个正整数，表示给定的序列。 第三个包含一个[详细]
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【讲古堂】大数四则运算加减乘除（入门篇）
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：199
行家看门道，外行看热闹。 加 IF(LEN(TEXT(G7,"00000000"))8,LEFT(TEXT(G7,"00000000"),LEN(TEXT(G7,"00000000"))-8),0) VALUE(RIGHT(TEXT(G7,8)) 减 G15-G17 IF(G200,-1,0) IF(F210,100000000,0) G21+G22+G20 乘 G27*$G$29 VALUE(IF(LEN(TEXT(G32,LEFT(TEXT[详细]
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树的内核：量化树结构化数据之间的相似性
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：119
一个深入的树内核的信息概述，无论是理论还是实践。包括一个案例和一些代码后的讨论。 网络和图形是一种节点形式的结构化数据类型，它们之间的关系描述为链接，或边缘。图中的节点和边可能有几个属性，可能是数字或分类，甚至更复杂。 今天，大量的数据是可[详细]
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从 LinkedIn 的数据处理机制学习数据架构
所属栏目：[大数据] 日期：2020-12-14 热度：89
http://www.36dsj.com/archives/40584 译者：伯乐在线-塔塔 网址：http://blog.jobbole.com/69344/ LinkedIn是当今最流行的专业社交网站之一，本文描述了LinkedIn是如何管理数据的。如你对文中的观点有异议亦或文中有遗漏的部分请随时告诉我。 LinkedIn.com[详细]
