awk – 获得每行平均值

发布时间：2020-12-14 01:12:19 所属栏目：Linux 来源：网络整理

导读：我有这种格式的大型数据集 HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 我想计算每一行的平均值,从第5列开始直到行结束,并忽略字符串NA.然后将平均值附加到每行的末尾. 输出看起来像这样： HF TLLL A T

我有这种格式的大型数据集

HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87

我想计算每一行的平均值,从第5列开始直到行结束,并忽略字符串NA.然后将平均值附加到每行的末尾.

输出看起来像这样：

HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.775
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.620

我一直得到这样的总和,但无法弄清楚如何跟踪求和的整数数,以便计算平均值.

awk '{x=0;for(i=5;i<=NF;i++)x=x+$i;print $0,x}'

解决方法

$cat file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87
HF TLLM A T NA NA NA NA NA NA NA

$awk '{sum=cnt=0; for (i=5;i<=NF;i++) if ($i != "NA") { sum+=$i; cnt++ } print $0,(cnt ? sum/cnt : "NA") }' file
HF TLLL A T 0.999 NA 0.666 NA 0.566 NA NA 0.87 0.77525
HF TLLM A T 0.500 0.500 0.666 0.566 NA NA 0.87 0.6204
HF TLLM A T NA NA NA NA NA NA NA NA

三元表达式避免了输入行3上的除零误差,其中每个数据字段都是“NA”.

（编辑：李大同）

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