由非root用户安装python包/工具

发布时间：2020-12-13 19:53:35 所属栏目：Linux 来源：网络整理

导读：(1)我必须安装一个 python包(HTSeq),但我没有root权限. 该软件包需要python 2.4或最新版本.我们的集群上有python 2.3. 因此我在我的一个本地目录上安装了python 2.7 运用 ./configure --prefix=/home/amit/tools/localpython make make install (2)该软件包

(1)我必须安装一个 python包(HTSeq),但我没有root权限.

该软件包需要python 2.4或最新版本.我们的集群上有python 2.3.

因此我在我的一个本地目录上安装了python 2.7
运用

./configure --prefix=/home/amit/tools/localpython 
make 
make install

(2)该软件包还需要numpy：所以我也使用以下方法将它安装在我的本地目录中：

/home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 setup.py install --home=/home/amit/tools/localnumpy

并做了

>>> sys.path.append("/home/amit/tools/localnumpy/lib/")

(3)我下载了HTSeq的tar文件(我想下载)并运行

/home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 setup.py install --home=/home/amit/tools/localhtseq

它抛出以下错误：

Could not import 'setuptools',falling back to 'distutils'.
Setup script for HTSeq: Failed to import 'numpy'.
Please install numpy and then try again to install HTSeq.

请告诉我如何克服它的一些提示

提前致谢

解决方法

Setuptools是安装该软件包所需的另一项要求.

一种选择是使用virtualenv来创建一个包含的python环境.这可以在任何地方进行,并由创建它的用户拥有.

要在没有管理员权限的情况下安装virtualenv(从this answer开始)：

下载最新版virtualenv的tar.gz.
打开包装.
您甚至不需要安装它,只需运行virtualenv.py,例如：

wget http://pypi.python.org/packages/source/v/virtualenv/virtualenv-1.7.1.2.tar.gz
tar -xzf virtualenv-1.7.1.2.tar.gz
/home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 virtualenv-1.7.1.2/virtualenv.py env

env/bin/pip install HTSeq
env/bin/pip install numpy

现在使用虚拟环境中的python二进制文件运行脚本：

env/bin/python myscript.py

（编辑：李大同）

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