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linux – 如何编辑300 GB文本文件(基因组数据)?

发布时间:2020-12-13 19:31:36 所属栏目:Linux 来源:网络整理
导读:我有一个300 GB的文本文件,其中包含超过250k记录的基因组数据.有些记录包含不良数据,我们的基因组程序Popoolution允许我们用星号注释掉“坏”记录.我们的问题是我们找不到将加载数据的文本编辑器,以便我们可以注释掉不良记录.有什么建议?我们有Windows和Lin

我有一个300 GB的文本文件,其中包含超过250k记录的基因组数据.有些记录包含不良数据,我们的基因组程序’Popoolution’允许我们用星号注释掉“坏”记录.我们的问题是我们找不到将加载数据的文本编辑器,以便我们可以注释掉不良记录.有什么建议?我们有Windows和Linux盒子.

更新:更多信息

程序Popoolution(https://code.google.com/p/popoolation/)在达到“坏”记录时崩溃,向我们提供我们可以注释掉的行号.具体来说,我们从Perl收到一条消息“F#

(编辑:李大同)

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