python – 如何从第二行开始使用readline()？

发布时间：2020-12-16 22:49:34 所属栏目：Python 来源：网络整理

导读：我正在用Python编写一个简短的程序来读取FASTA文件,该文件通常采用以下格式： gi|253795547|ref|NC_012960.1| Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome,52 linesGACGGCTTGTTTGCGTGCGACGAGTTTAGGATTGCTCTTTTGCTAAGCTTGGGGGTTGCGCCCAAAGTGATTAGATTTTC

我正在用Python编写一个简短的程序来读取FASTA文件,该文件通常采用以下格式：

>gi|253795547|ref|NC_012960.1| Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome,52 lines
GACGGCTTGTTTGCGTGCGACGAGTTTAGGATTGCTCTTTTGCTAAGCTTGGGGGTTGCGCCCAAAGTGA
TTAGATTTTCCGACAGCGTACGGCGCGCGCTGCTGAACGTGGCCACTGAGCTTACACCTCATTTCAGCGC
TCGCTTGCTGGCGAAGCTGGCAGCAGCTTGTTAATGCTAGTGTTGGGCTCGCCGAAAGCTGGCAGGTCGA

我已经创建了另一个程序来读取这个FASTA文件的第一行(又名标题),现在我希望第二个程序从序列开始读取和打印.

我该怎么办？

到目前为止我有这个：

FASTA = open("test.txt","r")

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line          


readSeq(FASTA)

多谢你们

-菜鸟

最佳答案

def readSeq(FASTA):
    """returns the DNA sequence of a FASTA file"""
    _unused = FASTA.next() # skip heading record
    for line in FASTA:
        line = line.strip()
        print line

阅读the docs on file.next()以了解为什么你应该警惕将file.readline()与for file in file混合：

（编辑：李大同）

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