加入收藏 | 设为首页 | 会员中心 | 我要投稿 李大同 (https://www.lidatong.com.cn/)- 科技、建站、经验、云计算、5G、大数据,站长网!
当前位置: 首页 > 大数据 > 正文

blast结果的m7格式转换为m8格式

发布时间:2020-12-15 21:11:02 所属栏目:大数据 来源:网络整理
导读:今天PHP站长网 52php.cn把收集自互联网的代码分享给大家,仅供参考。 while (){ if (/Iteration_query-def/) { /(.*?)/; $out1=$1; } if (/Hit_def/) { /(.*?)/; $out2=$1; } if (/Hsp_bit-score/) { /(.*?)/; $out12=$1;

以下代码由PHP站长网 52php.cn收集自互联网

现在PHP站长网小编把它分享给大家,仅供参考

while (<>)
{
   if (/Iteration_query-def/)
   {
   />(.*?)</;
   $out1=$1;
   }
   if (/Hit_def/)
   {
    />(.*?)</;
   $out2=$1;
   }
   if (/Hsp_bit-score/)
   {
    />(.*?)</;
   $out12=$1;
   }
   if (/Hsp_evalue/)
   {
   />(.*?)</;
   $out11=$1;
   }
   if (/Hsp_query-from/)
   {
     />(.*?)</;
   $out7=$1;
   }
   if (/Hsp_query-to/)
   {
   />(.*?)</;
   $out8=$1;
   }
   if (/Hsp_hit-from/)
   {
    />(.*?)</;
   $out9=$1;
   }
   if (/Hsp_hit-to/)
   {
    />(.*?)</;
   $out10=$1;
   }
   if (/Hsp_align-len/)
   {
   />(.*?)</;
   $out4=$1;
   }
   if (/Hsp_gaps/)
   {
    />(.*?)</;
   $out6=$1;
   }
     if (/Hsp_identity/)
   {
    />(.*?)</;
   $tmp=$1;
   }

   if (/Hsp_qseq/)
   {
    $out3=100*$tmp/$out4;
    $out3=sprintf"%0.2f",$out3;
    $out5=$out4-$tmp-$out6;
    print "$out1t$out2t$out3t$out4t$out5t$out6t$out7t$out8t$out9t$out10t$out11t$out12n";
   }

}

以上内容由PHP站长网【52php.cn】收集整理供大家参考研究

如果以上内容对您有帮助,欢迎收藏、点赞、推荐、分享。

(编辑:李大同)

【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容!

    推荐文章
      热点阅读