你如何比较两个树状图之间的“相似性”(R)？
发布时间：2020-12-14 04:18:34 所属栏目：大数据 来源：网络整理
导读：我有两个树状图,我想相互比较,以找出它们是如何“相似”的.但是我不知道有什么方法这样做(更别提代码来实现它,比如说在R中). 任何潜在客户 更新(2014-09-13)： 自从提出这个问题以来,我已经写了一个名为dendextend的R包,用于树形图的可视化,操纵和比较.该软
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我有两个树状图,我想相互比较,以找出它们是如何“相似”的.但是我不知道有什么方法这样做(更别提代码来实现它,比如说在R中).
任何潜在客户 更新(2014-09-13)： 自从提出这个问题以来,我已经写了一个名为dendextend的R包,用于树形图的可视化,操纵和比较.该软件包在CRAN上,并附有detailed vignette.它包括诸如cor_cophenetic,cor_bakers_gamma和Bk / Bk_plot之类的功能.以及用于视觉比较两棵树的纠缠图函数. 解决方法
比较树形图与比较分层聚类不一样,因为前者包括分支的长度以及分割,但是我也认为这是一个好的开始.我建议你阅读E. B. Fowlkes& C.L.Mallows(1983). “比较两个层次聚类的方法”.美国统计协会杂志78(383)：553-584
(link).
他们的方法是基于在每个级别k上切割树木,得到一个量化Bk,将分组与k簇进行比较,然后检查Bk对k图. Bk的测量基于查看对象对,并查看它们是否落入同一个集群中. 我确定可以根据这种方法编写代码,但首先我们需要知道如何在R中表示树形图. （编辑：李大同） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |