ChIP-seq基本分析流程

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前年在中科院做培训时，整理了一套ChIP-seq分析流程，截选实战部分，略作修改，分享出来，希望大家指正。

那次培训内容比较杂，还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用,前面已经分享过，链接如下：

• UCSC XENA - 集大成者(TCGA,ICGC)
• ICGC数据库使用
• TCGA数据库在线使用

下面步入正题，从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度，到分析整体流程，再到每一步如序列比对，富集效率评估、热图、峰图可视化，deeptools2使用、peak calling和motif分析等。

我们也打算于2018年4月14在北京鼓楼推出《ChIP-seq分析专题培训》，在此基础上继续深入讲解ChIP-seq分析，希望有兴趣的朋友加入。具体见文末或点击 阅读原文了解。

在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》于2018年4月14在北京鼓楼推出《ChIP-seq分析专题培训》，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个ChIP-seq实战分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创线下集中授课2天+自行练习5天+再集中讲解答疑2天三段式教学，并提供学习视频，教、学、练、答结合，真正实现独立分析大数据。

关于学习生物信息学分析的重要性，请阅读《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺的人》。

ChIP-seq基本分析流程如上。课程将在这个基础上，提供更深入地分析指导。

1. 座位按报名并成功缴费顺序从前到后龙摆尾式排序。
2. 赠送价值188元线上生信基础课程一门，目前的《应用Python处理生物信息数据和作图》、《生物信息作图系列R、Cytoscape及图形排版》和《生物信息中的Linux应用》任选其一。(http://bioinfo.ke.qq.com)
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具体信息请点击 阅读原文 (www.ehbio.com/Training)访问。

（编辑：李大同）

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