可视化R函数依赖项

发布时间：2020-12-14 00:50:29 所属栏目：百科来源：网络整理

导读：想要可视化包依赖关系的人有很多资源,但我特别感兴趣的是可视化包中的函数以及它们之间的依赖关系.有一些像 miniCRAN这样的工具用于绘制包依赖关系,但是包中是否有可用于图函数依赖的东西？例如,假设我的包中只有两个函数. func1 - function(n) return(LETT

想要可视化包依赖关系的人有很多资源,但我特别感兴趣的是可视化包中的函数以及它们之间的依赖关系.有一些像 miniCRAN这样的工具用于绘制包依赖关系,但是包中是否有可用于图函数依赖的东西？

例如,假设我的包中只有两个函数.

func1 <- function(n) return(LETTERS[n])
func2 <- function(n) return(func1(n%%26+1))

然后我只想要一个带有两个标记节点的图形和连接它们的边缘,描绘func2对func1的依赖性.

我认为有很多软件包具有非常强大的功能依赖性,这样的实用程序可以帮助理解/组织/重构/等.

谢谢.

我认为一个更好的选择(建立在mvbutil包的foodweb函数之上)是由Github上的datastorm-open构建的DependenciesGraph包,它们是更通用的 visNetwork包.

> DependenciesGraph：用于包和函数之间的依赖关系可视化的R包

在我的例子中,我一直在想象我自己的包维护和开发,并对结果非常满意.

library(DependenciesGraph)
library(QualtricsTools) # A package I'm developing
deps <- funDependencies("package:QualtricsTools","generate_split_coded_comments")
plot(deps)

输出是一个Web服务器(在RStudio的查看器中或在单独的浏览器中查看),允许您通过下拉或单击它们来选择特定功能,放大和缩小,拖动它们等等.对我来说,这比使用base R绘制foodweb函数的输出要好得多,因为通常很难让文本看起来很好地显示在每个节点的顶??部,所有的边缘在foodweb图中都有不同的颜色,并且在我看来,基本R绘图函数正在做很多工作以确保绘图的布局可读或清晰.

与mvbutil的foodweb比较：

library(mvbutils)
library(QualtricsTools) 
deps <- foodweb(where="package:QualtricsTools",prune='make_split_coded_comments')
plot(deps)

(对不起,名称有差异,它们的功能完全相同,我恰好在制作这两个图之间重新命名了功能).

（编辑：李大同）

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