将部分文件名分配给bash变量？

发布时间：2020-12-15 22:11:26 所属栏目：安全来源：网络整理

导读：我有一个文件,它的名字如下： 12U12345._L001_R1_001.fastq.gz 我想仅为12U12345部分分配一个变量. 到目前为止,我有： variable=`basename $fastq | sed {s'/_S[0-9]*_L001_R1_001.fastq.gz//'}` 注意：$fastq是一个变量,其中包含文件的完整路径. 这个解决方

我有一个文件,它的名字如下：

12U12345._L001_R1_001.fastq.gz

我想仅为12U12345部分分配一个变量.

到目前为止,我有：

variable=`basename $fastq | sed {s'/_S[0-9]*_L001_R1_001.fastq.gz//'}`

注意：$fastq是一个变量,其中包含文件的完整路径.

这个解决方案目前返回完整的文件名,任何想法如何做到这一点？

解决方法

只需使用shell提供的内置参数扩展,而不是生成一个单独的进程

fastq="12U12345._L001_R1_001.fastq.gz"
printf '%sn' "${fastq%%.*}"
12U12345

或者使用printf()本身来存储一次性的新变量

printf -v numericPart '%s' "${fastq%%.*}"
printf '%sn' "${numericPart}"

bash还有一个内置的正则表达式比较运算符,用~~表示你可以做的

fastq="12U12345._L001_R1_001.fastq.gz"
regex='^([[:alnum:]]+).(.*)'

if [[ $fastq =~ $regex ]]; then
    numericPart="${BASH_REMATCH[1]}"
    printf '%sn' "${numericPart}"
fi

（编辑：李大同）

【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容!