在R中管道两个bash命令：管道错误

发布时间：2020-12-15 22:00:39 所属栏目：安全来源：网络整理

导读：我正在尝试在R中管道两个bash命令但是我得到一个损坏的管道错误;任何建议表示赞赏. 我就在这里： #Create a long file (2GB on your drive...)write.csv(rep(1,1E8),file="long.txt",row.names=FALSE)system("grep 1 tmp.txt") #This workssystem("grep 1 tm

我正在尝试在R中管道两个bash命令但是我得到一个损坏的管道错误;任何建议表示赞赏.
我就在这里：

#Create a long file (2GB on your drive...)
write.csv(rep(1,1E8),file="long.txt",row.names=FALSE)

system("grep 1 tmp.txt")    #This works
system("grep 1 tmp.txt| head -n 10")    #This gives a broken pipe error

我得到grep：写输出：断管
使用短文件它可以正常工作.
我该如何工作呢？

谢谢.

解决方法

grep抱怨是因为它有超过10行的输出,并且头部在它完成之前将其切断.

我建议隐藏grep的stderr输出(这是打印管道错误的地方).

system("grep 1 tmp.txt 2>/dev/null | head -n 10")

如果你需要从grep看到其他错误,这将不起作用;在这种情况下,您将需要一个更复杂的解决方案.

（编辑：李大同）

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