xmlstarlet选择具有特定属性值的节点

发布时间：2020-12-15 21:01:18 所属栏目：安全来源：网络整理

导读：我是所有这一切的新手所以请原谅我,如果答案是完全明显的！我有一个从NCBI下载的 XML文档,我试图从每个条目中提取主机信息,这看起来像这样(但更深层次嵌套)： OrgName_mod OrgMod OrgMod_subtype value="strain"2/OrgMod_subtype OrgMod_subnameMvs/Jiroft.I

我是所有这一切的新手所以请原谅我,如果答案是完全明显的！我有一个从NCBI下载的 XML文档,我试图从每个条目中提取主机信息,这看起来像这样(但更深层次嵌套)：

<OrgName_mod>
    <OrgMod>
        <OrgMod_subtype value="strain">2</OrgMod_subtype>
        <OrgMod_subname>Mvs/Jiroft.IRN/14.15/1[B3]</OrgMod_subname>
    </OrgMod>
    <OrgMod>
        <OrgMod_subtype value="nat-host">21</OrgMod_subtype>
        <OrgMod_subname>Homo sapiens</OrgMod_subname>
    </OrgMod>
</OrgName_mod>

我使用以下方法取得了成功：

xml sel -t -v //OrgName_mod/OrgMod[2]/OrgMod_subname -n file.xml

但问题是OrgMod节点中有时会有更多或更少的信息,而主机并不总是处于第二位置.所以我尝试了几乎每个版本都尝试选择主机节点：

xml sel -t -m //OrgMod/OrgMod_subtype[@value=nat-host] -v ../OrgMod_subname -n file.xml

我想选择带有nat-host属性的OrgMod_subtype节点,然后打印带有种类名称的兄弟(？)OrgMod_subname节点.

任何帮助将不胜感激！

解决方法

试试这种方式：

//OrgMod[OrgMod_subtype/@value = 'nat-host']/OrgMod_subname/text()

（编辑：李大同）

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