是否可以使用readr中的write_csv()编写stdout？

发布时间：2020-12-15 17:03:11 所属栏目：安全来源：网络整理

导读：我正在使用bash通过Rscript管道数据,如下所示： cat random.csv | Rscript test.R arg | delete.csv 我的目标是使用R包读取器来读取stdin和写入stdout.我找到了answer to stdin here. test.R #!/usr/bin/RscriptsuppressMessages(library(readr))args - comm

我正在使用bash通过Rscript管道数据,如下所示：

cat random.csv | Rscript test.R arg> | delete.csv

我的目标是使用R包读取器来读取stdin和写入stdout.我找到了answer to stdin here.

test.R

#!/usr/bin/Rscript
suppressMessages(library(readr))

args  <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)

df.in <- read_csv(file("stdin"))

write_csv(df.in,path = stdout())

上面的代码在命令行中生成以下错误消息：

错误信息

Error in path.expand(path) : invalid 'path' argument
Calls: write_csv -> write_delim -> normalizePath -> path.expand
Execution halted

我还尝试了write_csv(df.in,file(“stdout”))和write_csv(df.in,stdout()),产生相同的错误消息.

为了重现性,这里是random.csv的链接

Definition of variables,by WHO for the Global Tuberculosis Report [43kb]

readr中有一个format_csv函数.使用它而不是write_csv：

cat(format_csv(df.in))

（编辑：李大同）

【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容!