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有没有办法让R运行脚本并在错误时将非0返回给shell?

发布时间:2020-12-15 17:02:47 所属栏目:安全 来源:网络整理
导读:给定一个包含3行的文件script.R: print('hello')stop('user error')print('world') 我们可以运行它: $R -f script.R print('hello')[1] "hello" stop('user error')Error: user error print('world')[1] "world" 但在错误发生后仍然如此.我希望它在出错时
给定一个包含3行的文件script.R:
print('hello')
stop('user error')
print('world')

我们可以运行它:

$R -f script.R
> print('hello')
[1] "hello"
> stop('user error')
Error: user error
> print('world')
[1] "world"

但在错误发生后仍然如此.我希望它在出错时暂停脚本.这样做:

$R -e "source('script.R')"
> source('script.R')
[1] "hello"
Error in eval(expr,envir,enclos) : user error
Calls: source -> withVisible -> eval -> eval

好.它停止在错误上运行脚本.但是shell的返回值是0(成功):

$echo $?
0

反正有没有运行脚本,停止错误,并返回非零到shell?我搜查了一下,找不到答案.

我可以grep输出文件中的文本“错误”,但这有一些需要管理的风险;例如以某种方式greping错误的输出文件并且两次或多次运行写入同一文件.可以管理这些问题,但是将非零返回到shell会更简单,更健壮.在脚本末尾添加一行也是一种解决方法,因为我需要将该行添加到所有脚本中.

感谢@Pascal的评论,结果发现在我的.Rprofile中我有:
options(error=quote(dump.frames()))

当我使用–vanilla运行以防止我的.Rprofile被加载:

$R --vanilla -f script.R
> print('hello')
[1] "hello"
> stop('user error')
Error: user error
Execution halted
$echo $?
1

这正是我想要的并解决问题.谢谢@Pascal!

(编辑:李大同)

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