使用Rscript通过Bash脚本参数查询data.frame

发布时间：2020-12-15 17:01:05 所属栏目：安全来源：网络整理

导读：如果我有一个R脚本： #! /usr/bin/env Rscriptargs - commandArgs(TRUE)t - read.table(args[2],header = TRUE)print(t$args[1])q(status = 0) 我使用TSV文件“example-table.tsv”： "a" "b"1 32 23 1 …使用Bash命令：./ example.R example-table.tsv …(

如果我有一个R脚本：

#! /usr/bin/env Rscript
args <- commandArgs(TRUE)

t <- read.table(args[2],header = TRUE)
print(t$args[1])

q(status = 0)

我使用TSV文件“example-table.tsv”：

"a" "b"
1 3
2 2
3 1

…使用Bash命令：./ example.R example-table.tsv …(当然,在使R脚本可执行之后)

为什么t $args [1]返回NULL？我如何让这个例子返回我在脚本参数中指定的正确的data.frame列？

谢谢你的帮助！

我意识到这可能是也可能不是一个更好的编程问题,而不是Cross Validated ……？

尝试：

print(t[[args[1]]])

请注意,t $args [1]被解析为(t $args)[1] – > NULL [1] – >为NULL,因为您的data.frame没有’a??rgs’列.

（编辑：李大同）

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