bash – 在命令行上使用R脚本的最好方法是什么？

#!/path/to/R
...

要么

#!/usr/bin/env R
...

但我没有能够做这些工作。

另一个选择是保持脚本纯粹在R，例如。 script.R，并使用R – file = script.R或类似方法调用它。然而，偶尔，脚本将依赖于模糊的命令行开关，在该点处代码的一部分存在于脚本之外。示例：通过本地.Rprofile从bash中将东西转换成R，那么所需的开关就是–noilla，除了–no-init-file。

另一个选项是一个bash脚本来存储R标志并且无痛地执行，然后调用R脚本。问题是，这意味着单个程序只是被分成两个文件，现在必须保持同步，一起传输到新的机器等。

我目前最不喜欢的选择是嵌入R在一个bash脚本：

#!/bin/bash
... # usage message to catch bad input without invoking R
... # any bash pre-processing of input
... # etc
R --random-flags <<RSCRIPT
# R code goes here
RSCRIPT

一切都在一个单一的文件。它是可执行的，并且容易处理参数。问题是，bash和R这样的组合几乎消除了任何IDE不会失败的可能性在一个或另一个，并使我的心伤害真正的坏。

有没有一些更好的方式，我错过了？