如何在Windows上使用R设置和使用MPI

发布时间：2020-12-14 02:16:04 所属栏目：Windows 来源：网络整理

导读：我从网上下载了一个R脚本,说它“必须在MPI环境中运行”.现在我完全不知道MPI,除了它用于并行计算,并且很难找到关于如何设置和使用它的简单教程. 有人可以给我一个简单的,逐步指导我应该安装什么来运行它,我应该怎么做,以及我如何运行脚本？提前致谢. 编辑,

我从网上下载了一个R脚本,说它“必须在MPI环境中运行”.现在我完全不知道MPI,除了它用于并行计算,并且很难找到关于如何设置和使用它的简单教程.

有人可以给我一个简单的,逐步指导我应该安装什么来运行它,我应该怎么做,以及我如何运行脚本？

提前致谢.

编辑,这是我试过的：

>我安装了Microsoft MPI
>我在R中安装并加载了RMpi包

具体问题：

> # number of available slots is passed via environment variable
> slots <- as.integer(Sys.getenv("NSLOTS"))

给出NA_integer_.

如果我使用以下(即我用一些标量替换Sys.getenv(“NSLOTS”))

> slots <- as.integer(4)
> cl <- snow::makeMPIcluster(slots)

我收到了错误

Error in mpi.comm.spawn(slave = mpitask,slavearg = args,nslaves =
count,: Other MPI error,error stack:
MPI_Comm_spawn(cmd=”C:/PROGRA~1/R/R-31~1.0/bin/Rscript.exe”,
argv=0x0000000009A12CA8,maxprocs=4,MPI_INFO_NULL,root=0,
MPI_COMM_SELF,intercomm=0x000000000A2FF8B0,
errors=0x00000000100E3C70) failed Function not implemented

所以我怀疑我没有正确配置我的MPI环境.

解决方法

尝试这一行,……

> require(parallel) 
> nCores <- 8  # manually for non-cluster machines
> cl <- makeCluster(nCores) # by default this uses the PSOCK mechanism as in the SNOW package

（编辑：李大同）

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