linux – 通过计算集群加载python模块

发布时间：2020-12-14 01:43:20 所属栏目：Linux 来源：网络整理

导读：我有一个使用Scientific Linux的计算集群的帐户.当然我只有用户访问权限.我正在使用python,我需要运行python脚本,所以我需要导入一些python模块.由于我没有root访问权限,因此我在$HOME上安装了一个包含所有必需模块的本地python副本.当我在我的帐户(托管节点

我有一个使用Scientific Linux的计算集群的帐户.当然我只有用户访问权限.我正在使用python,我需要运行python脚本,所以我需要导入一些python模块.由于我没有root访问权限,因此我在$HOME上安装了一个包含所有必需模块的本地python副本.当我在我的帐户(托管节点)上运行脚本时,它们正确运行.但是为了将作业提交到计算队列(在更快的机器上处理),我需要提交一个bash脚本,该脚本具有执行脚本的行.计算群集使用SunGrid Engine.但是,当我提交bash脚本时,我收到一个错误,我找不到我安装的模块！我无法弄清楚出了什么问题.我希望你能帮忙.

解决方法

你可以简单地用bash脚本调用你的python程序,例如：PYTHONPATH = $HOME / lib / python / path / to / my / python my_python_script

我不知道SunGrid是如何工作的,但如果它使用的用户与您的不同,则需要对$HOME进行全局读取访问.或者至少到python库.

（编辑：李大同）

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