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linux – IO阻塞进程是否会在’top’输出中显示100%的CPU利用率

发布时间:2020-12-14 00:33:40 所属栏目:Linux 来源:网络整理
导读:我有一个可以在不同数量的进程上并行化的分析.预计事情将是IO和CPU密集型(如果有人好奇的话,非常高吞吐量的短读取DNA对齐.) 运行它的系统是48核linux服务器. 问题是如何确定最佳的过程数量,以便最大化总吞吐量.在某些时候,这些过程可能会成为IO限制,因此添加
我有一个可以在不同数量的进程上并行化的分析.预计事情将是IO和CPU密集型(如果有人好奇的话,非常高吞吐量的短读取DNA对齐.)

运行它的系统是48核linux服务器.

问题是如何确定最佳的过程数量,以便最大化总吞吐量.在某些时候,这些过程可能会成为IO限制,因此添加更多过程将没有任何好处,也可能是有害的.

当达到这一点时,我能从标准系统监控工具中判断出来吗?
top(或者可能是不同的工具)的输出是否能够区分IO绑定和CPU绑定进程?我怀疑IO上阻止的进程可能仍然显示100%的CPU利用率.

解决方法

即使是单个IO绑定进程也很少显示高CPU利用率,因为操作系统已经安排了IO并且通常只是等待它完成.因此,top无法准确区分IO绑定进程和仅仅定期使用CPU的非IO绑定进程.事实上,一个可怕的超载所有IO绑定进程的系统,几乎无法完成任何事情,可能会表现出非常低的CPU利用率.

仅使用top作为第一遍,您实际上只能继续添加线程/进程,直到关闭CPU利用率以确定给定计算机的近似配置.

(编辑:李大同)

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