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使用awk组合单个文件中的列

发布时间:2020-12-14 00:05:19 所属栏目:Linux 来源:网络整理
导读:我正在尝试重新格式化一个大文件.每行的前6列都可以,但行中的其余列需要以2为增量组合,其间带有“/”字符. 示例文件(仅显示几列,但在实际文件中有更多列): 1 1 0 0 1 2 A T A C 成: 1 1 0 0 1 2 A/T A/C 到目前为止,我一直在尝试awk,这就是我在… awk '{pr
我正在尝试重新格式化一个大文件.每行的前6列都可以,但行中的其余列需要以2为增量组合,其间带有“/”字符.

示例文件(仅显示几列,但在实际文件中有更多列):

1       1       0       0       1       2       A       T       A       C

成:

1       1       0       0       1       2       A/T     A/C

到目前为止,我一直在尝试awk,这就是我在…

awk '{print $1,$2,$3,$4,$5; for(i=7; i < NF; i=i+2) print $i+"/"+$i+1}'  myfile.txt > mynewfile.txt

解决方法

awk '{for(i=j=7; i < NF; i+=2) {$j = $i"/"$(i+1); j++} NF=j-1}1' input

(编辑:李大同)

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