linux – 如何使用默认的R安装通过conda安装rpy2

发布时间：2020-12-13 23:19:13 所属栏目：Linux 来源：网络整理

导读：我在Ubuntu linux上使用Anaconda Python发行版,并希望在IPython笔记本中使用R magics.有没有办法用conda发行版安装rpy2并在/usr/bin/R使用我当前的默认R安装？我的目标是保持当前的R安装,而无需通过conda安装R或其他R软件包. 这个response to a related ques

我在Ubuntu linux上使用Anaconda Python发行版,并希望在IPython笔记本中使用R magics.有没有办法用conda发行版安装rpy2并在/usr/bin/R使用我当前的默认R安装？我的目标是保持当前的R安装,而无需通过conda安装R或其他R软件包.

这个response to a related question建议在mac上使用配方,但对我不起作用：

conda skeleton pypi rpy2
conda build rpy2
conda install rpy2 --use-local

build命令产生以下错误：

Error: No packages found in current linux-64 channels matching:  singledispatch

我可以通过binstar安装singledispatch：

conda install -c https://conda.binstar.org/asmeurer singledispatch

conda list | grep "singledispatch"
singledispatch            3.4.0.3                  py27_1

但是在当前的linux-64频道中找不到包,我得到了同样的错误.

解决方法

我有一个类似的问题,包没有安装在适当的地方,我建议改为使用apt而不是conda

sudo apt安装python-rpy2

编辑：*注意rpy2的官方支持已经停止2.7 *

（编辑：李大同）

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