string – 从Linux中形成的文本文件中读取内容bash [复制]

发布时间：2020-12-13 19:50:34 所属栏目：Linux 来源：网络整理

导读：参见英文答案 How to concatenate string variables in Bash28个我正在尝试使用wget和url从数据库下载文件.例如. wget“http://www.rcsb.org/pdb/files/1BXS.pdb” 所以url的格式是这样的：http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb“ 但我有很多文件

参见英文答案 > How to concatenate string variables in Bash28个
我正在尝试使用wget和url从数据库下载文件.例如.

wget“http://www.rcsb.org/pdb/files/1BXS.pdb”

所以url的格式是这样的：http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb“

但我有很多文件需要下载;所以我写了一个bash脚本,从文本文件中读取id_numbers,形成url字符串并通过wget下载.

!/bin/bash

while read line
do
url="http://www.rcsb.org/pdb/files/$line.pdb"
echo -e $url
wget $url
done < id_numbers.txt

但是,url字符串形成为

.pdb://www.rcsb.org/pdb/files/4H80

所以,.pdb充满了http.我无法弄清楚为什么.有没有人有想法？
我如何格式化它以便url

"http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb"

？
非常感谢.

注意.这个问题被标记为“如何在bash中连接字符串？”的副本但我实际上是在寻求别的东西.我在问这个问题之前就已经阅读了这个问题,事实证明我的问题是在Windows中准备txt文件并不是真正的字符串.我编辑了问题标题.我希望现在更清楚了.

解决方法

听起来你的id_numbers.txt文件有DOS / Windows风格的行结尾(回车后跟换行字符)而不是普通的unix行结尾(只是换行).结果是read认为该行以回车符结束,$line实际上在末尾有一个回车符,并且嵌入在url中,导致各种混淆.

有几种方法可以解决这个问题.使用它时,您可以从变量中修改回车符：

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/${line%$'r'}.pdb"

或者你可以通过告诉它将回车计为空格来读取它(读取将从它读取的内容中修剪前导和尾随空格)：

while IFS=$'r' read line

或者您可以使用dos2unix(或操作系统上的等效项)之类的命令来转换id_numbers.txt文件.

（编辑：李大同）

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