在Linux中运行R脚本时等待用户输入
发布时间:2020-12-13 19:17:13 所属栏目:Linux 来源:网络整理
导读:我有一段代码提示用户输入,并在 Windows中运行代码时完美地工作.但是,在 Linux中,它执行每一行而不等待用户输入. 我已将代码添加到单独的函数中并使用系统(“stty -echo”)但未成功. 为什么会发生这种情况,可以做些什么? (执行命令:Rscript test.R) requir
我有一段代码提示用户输入,并在
Windows中运行代码时完美地工作.但是,在
Linux中,它执行每一行而不等待用户输入.
我已将代码添加到单独的函数中并使用系统(“stty -echo”)但未成功. require(Biostrings) read_value <- function(prompt_text = "",prompt_suffix = getOption("prompt"),coerce_to= "character") { prompt <- paste(prompt_text,prompt_suffix) system("stty -echo") as(readline(prompt),coerce_to) } prints<-function() { opt<-as.character(readline(prompt = "Enter parameter values: ")) system("stty -echo") i<-1 while ((i<=5)) { if (i==1) { expr.filename <- as.character(readline(prompt = "Expression file name: ")) tryCatch( {expr.file<-read.table(expr.filename)},error=function(e) {print("ERROR : Enter valid filename!") return }) } if (i==2) { system("stty -echo") fasta.filename <- as.character(readline(prompt = "Fasta file name: ")) tryCatch( {sequence_data<-read.DNAStringSet(fasta.filename)},error=function(e) {print("ERROR : Enter valid filename!") return }) } #missing piece of code i<-i+1 } 解决方法
您可能需要考虑使用“stdin”中的readLines.提示功能用于记录数据集.
cat("Please enter a file name ...") fil <- readLines(con="stdin",1) cat(fil,"n") 保存为filnam.r ….使用: user-linux-prompt$ Rscript filnam.r (编辑:李大同) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |