在python中读取没有标题的.img医学图像

发布时间：2020-12-20 11:45:46 所属栏目：Python 来源：网络整理

导读：我有一个没有头文件的放射线照片.img文件.但是,已发布该文件的研究人员已经提供了有关它的信息 High resolution (2048 × 2048 matrix size,0.175mm pixel size)Wide density range (12-bit,4096 gray scale)Universal image format (no header,big-endian r

我有一个没有头文件的放射线照片.img文件.但是,已发布该文件的研究人员已经提供了有关它的信息

High resolution (2048 × 2048 matrix size,0.175mm pixel size)
Wide density range (12-bit,4096 gray scale)
Universal image format (no header,big-endian raw data)

我试图使用Python打开文件但无法这样做.有人可以建议任何方法来读取此图像文件吗？

解决方法

我通过下载 JSRT database找到了一些像你这样的射线照片图像.我在这个数据库的第一张图片上测试了下面的代码：JPCLN001.IMG.

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# Parameters.
input_filename = "JPCLN001.IMG"
shape = (2048,2048) # matrix size
dtype = np.dtype('>u2') # big-endian unsigned integer (16bit)
output_filename = "JPCLN001.PNG"

# Reading.
fid = open(input_filename,'rb')
data = np.fromfile(fid,dtype)
image = data.reshape(shape)

# Display.
plt.imshow(image,cmap = "gray")
plt.savefig(output_filename)
plt.show()

它生成一个输出文件JPCLN001.PNG,如下所示：

First image of the JSRT database

我希望我已经回答了你的问题.快乐的编码！

（编辑：李大同）

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