for-loop – 互补DNA序列

发布时间：2020-12-20 11:29:46 所属栏目：Python 来源：网络整理

导读：我在写这个循环时遇到了问题;它似乎在第二个序列后停止. 我想将互补的DNA序列返回到给定的DNA序列. 例如. (‘AGATTC’) – (‘TCTAAG’),其中A：T和C：G def get_complementary_sequence(dna): """(str) - str Return the DNA sequence that is complementar

我在写这个循环时遇到了问题;它似乎在第二个序列后停止.

我想将互补的DNA序列返回到给定的DNA序列.

例如. (‘AGATTC’) – > (‘TCTAAG’),其中A：T和C：G

def get_complementary_sequence(dna):
    """(str) -> str

> Return the DNA sequence that is complementary to the given DNA sequence

    >>> get_complementary_sequence('AT')
    ('TA')
    >>> get_complementary_sequence('AGATTC')
    ('TCTAAG')

    """

    x = 0
    complementary_sequence = ''

    for char in dna:
            complementary_sequence = (get_complement(dna))

    return complementary_sequence + (dna[x:x+1])

谁能发现循环不能继续的原因？

解决方法

以下是我将如何做的示例 – 实际上只有两行代码：

from string import maketrans

DNA="CCAGCTTATCGGGGTACCTAAATACAGAGATAT" #example DNA fragment

def complement(sequence):
  reverse = sequence[::-1]
  return reverse.translate(maketrans('ATCG','TAGC'))

print complement(DNA)

（编辑：李大同）

【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容!