python – 如何使MRI图像居中
发布时间:2020-12-20 11:07:54 所属栏目:Python 来源:网络整理
导读:我在MRI上工作.问题是图像并不总是居中.此外,患者身体周围通常有黑带. 我希望能够移除黑色边框并使患者的身体居中,如下所示: 我已经尝试通过读取像素表来确定患者身体的边缘,但我还没有提出任何非常确定的结论. 事实上,我的解决方案仅适用于50%的图像…我
我在MRI上工作.问题是图像并不总是居中.此外,患者身体周围通常有黑带.
我希望能够移除黑色边框并使患者的身体居中,如下所示: 我已经尝试通过读取像素表来确定患者身体的边缘,但我还没有提出任何非常确定的结论. 事实上,我的解决方案仅适用于50%的图像…我没有看到任何其他方法来做到这一点…… 开发环境:Python3.7 OpenCV3.4 解决方法
我不确定这是执行此操作的标准或最有效的方法,但它似乎有效:
# Load image as grayscale (since it's b&w to start with) im = cv2.imread('im.jpg',cv2.IMREAD_GRAYSCALE) # Threshold it. I tried a few pixel values,and got something reasonable at min = 5 _,thresh = cv2.threshold(im,5,255,cv2.THRESH_BINARY) # Find contours: im2,contours,hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE) # Put all contours together and reshape to (_,2). # The first "column" will be your x values of your contours,and second will be y values c = np.vstack(contours).reshape(-1,2) # Extract the most left,most right,uppermost and lowermost point xmin = np.min(c[:,0]) ymin = np.min(c[:,1]) xmax = np.max(c[:,0]) ymax = np.max(c[:,1]) # Use those as a guide of where to crop your image crop = im[ymin:ymax,xmin:xmax] cv2.imwrite('cropped.jpg',crop) 你到底得到的是: (编辑:李大同) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |