【Python】学习Python-igraph
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<span style="color:rgb(69,69,69);background-color:rgb(255,255,255);">总结：学习一种全新的语言看官方的文档是真的很有帮助，这次我的大部分python代码的完成都是靠着igraph官方的API文档。 <span style="color:rgb(69,255);">首先导入igraph工具包 from igraph import *（python语法） <span style="background-color:rgb(255,255);"><span style="color:#cc0000;">报错：No module named 'igraph._igraph'，原因是你在你安装源码的文件夹下import，这时import的不是你刚才安装的模块，而是自带的包。切换路径即可。 <span style="color:#cc0000;"><span style="background-color:rgb(255,255);">报错：DeprecationWarning: To avoid name collision with the igraph project,this visualization library has been renamed to 'jgraph'. Please upgrade when convenient. 原因是igraph强迫你更新，打开提示的init.py文件，把报错语句删除即可。（先别急着删除，往下看） <span style="color:rgb(69,255);">创建图 g = Graph.Tree(127,2) <span style="color:#cc0000;"><span style="background-color:rgb(255,255);">报错：AttributeError: module 'igraph' has no attribute 'Graph'。<span style="background-color:rgb(255,255);">原因是，官方有两个igraph库，一个是igraph，一个是python-igraph，安装错了，卸载pip uninstall igraph，重装?<span style="background-color:rgb(255,255);">pip install python_igraph-0.7.1.post4-cp27-none-win32.whl <span style="color:#cc0000;"><span style="background-color:rgb(255,255);">这里提示一下，楼主最后放弃安装，因为只有32位版本，不适合64位机器。而这个<a href="http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#python-igraph" rel="nofollow">网址中的64版本全部不能下载了，所以最后放弃了。 <span style="color:rgb(69,255);">运行fastunfloding算法 g.community_multilevel("weight",True)<br style="color:rgb(69,255);">绘制graph plot（g）<br style="color:rgb(69,255);">代码参考 fastunfloding.txt<br style="color:rgb(69,255);">给图添加边并且添加权值：g.add_edges([(0,1)])<br style="color:rgb(69,255);"><span style="color:rgb(69,255);">g.es[1]["weight"]=2<br style="color:rgb(69,255);">其中g.es[1]代表的是第一条边<br style="color:rgb(69,255);">最开始我的图是从数据库导出，即（点，点，权）这种模式所以就需要从txt文档中读边并且建立图<br style="color:rgb(69,255);">打开文件：f = open('D:test1test.txt','r')<br style="color:rgb(69,255);">读文件中一行：line = ?f.readline() 注：line是字符串的形式<br style="color:rgb(69,255);">取出文件一行的整数并且加入到数组尾部 result.append(map(int,line.split(',')))<br style="color:rgb(69,255);">读图完毕后就需要将图放到fastunfolding算法中去了<br style="color:rgb(69,255);">a = g.community_multilevel("weight",255);">官方API上说 当g.community_multilevel最后一个参数为True的时候<br style="color:rgb(69,255);">a返回的是一组list，list的存放位置在（a[0]）处，a[0][s]代表着<br style="color:rgb(69,255);">community为s的所有顶点<br style="color:rgb(69,255);">注：a list of VertexClustering objects,one corresponding to each level (if return_levels is True)<br style="color:rgb(69,255);">取list长度：len（a[0]）<br style="color:rgb(69,255);">将输入的图存成gml格式：g.write_graphmlz(self,f,compresslevel=9)<br style="color:rgb(69,255);">读gml格式的图：g = Graph.Read_GraphMLz("D:test1final_graph.gml")<span style="color:rgb(69,255);">转载自：http://blog.csdn.net/crazyacm/article/details/46444579 （编辑：李大同） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |