是否有一种方法可以用biopython从pubmed文章中获取完整的摘要？
发布时间：2020-12-16 21:30:55 所属栏目：Python 来源：网络整理
导读：我目前有以下代码查询pubmed： from Bio import EntrezEntrez.email = "kuharrw@hiram.edu" # Always tell NCBI who you arehandle = Entrez.esearch(db="pubmed",term="bacteria")record = Entrez.read(handle)list = record["IdList"]print len(list)for i
|
我目前有以下代码查询pubmed：
from Bio import Entrez
Entrez.email = "kuharrw@hiram.edu" # Always tell NCBI who you are
handle = Entrez.esearch(db="pubmed",term="bacteria")
record = Entrez.read(handle)
list = record["IdList"]
print len(list)
for index in range(0,len(list)):
listId = list[index]
handle = Entrez.esummary(db="pubmed",id=listId)
record = Entrez.read(handle)
print index
print record[0]["Title"]
print record[0]["HasAbstract"]
这段代码能够告诉我文章是否有摘要但我找不到任何关于如何实际返回摘要的文档.是否有可能使用biopython？如果不是有另一种方式？ 解决方法
是的,显然可以使用BioPython.如果您完全遵循此部分,您应该能够从pubmed获取摘要：
http://www.biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#sec142
如果您认为此链接没有帮助,请告诉我们.我很快就会回复你. （编辑：李大同） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |