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perl – 使用反引号调用的外部程序仍会产生输出

发布时间:2020-12-15 23:20:09 所属栏目:大数据 来源:网络整理
导读:所以我在perl中调用外部程序并想要捕获它的输出: my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters`; 如果从命令行调用,则输出由三行组成,例如: 4 sequences; length of alignment 48.__GCCGA_UGUAGCUCAGUUGGG_AGAGCGCCAGACUGAAAAUCAGA ...((((.....((((.
所以我在perl中调用外部程序并想要捕获它的输出:

my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters`;

如果从命令行调用,则输出由三行组成,例如:

4 sequences; length of alignment 48.
__GCCGA_UGUAGCUCAGUUGGG_AGAGCGCCAGACUGAAAAUCAGA 
...((((.....((((.........)))).(((((.......)))))

但是我的数组@RNAalifoldOut只包含最后两行,第一行直接出现在执行该行的屏幕上.

怎么会这样?我想也许程序可以将第一行写入STDERR,但是反引号运算符不会丢弃它吗?我该怎么做才能隐藏这个输出?

问候
缺口

解决方法

您可能会看到RNAalifold的标准错误.反引号仅捕获标准输出.

通过将代码更改为,捕获标准输出和标准错误

my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>&1`;

要丢弃标准错误,请使用

my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>/dev/null`;

在类Unix的平台上.在Windows上,使用

my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>nul`;

(编辑:李大同)

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