使用正则表达式选择R数据帧中的行

发布时间：2020-12-14 06:34:45 所属栏目：百科来源：网络整理

导读：我正在尝试在数据帧中选择列，其中列中包含的字符串与正则表达式或子字符串匹配：数据帧： aName bName pName call alleles logRatio strengthAX-11086564 F08_ADN103 2011-02-10_R10 AB CG 0.363371 10.184215AX-11086564 A01_CD1919 2011-02-24_R11 BB GG

我正在尝试在数据帧中选择列，其中列中包含的字符串与正则表达式或子字符串匹配：

数据帧：

aName   bName   pName   call  alleles   logRatio    strength
AX-11086564 F08_ADN103  2011-02-10_R10  AB  CG  0.363371    10.184215
AX-11086564 A01_CD1919  2011-02-24_R11  BB  GG  -1.352707   9.54909
AX-11086564 B05_CD2920  2011-01-27_R6   AB  CG  -0.183802   9.766334
AX-11086564 D04_CD5950  2011-02-09_R9   AB  CG  0.162586    10.165051
AX-11086564 D07_CD6025  2011-02-10_R10  AB  CG  -0.397097   9.940238
AX-11086564 B05_CD3630  2011-02-02_R7   AA  CC  2.349906    9.153076
AX-11086564 D04_ADN103  2011-02-10_R2   BB  GG  -1.898088   9.872966
AX-11086564 A01_CD2588  2011-01-27_R5   BB  GG  -1.208094   9.239801

例如，我想要一个仅包含列bName列中的ADN的数据帧。其次，我想在列bName中包含ADN的所有行，并且在列pName中匹配2011-02-10_R2。

我尝试使用函数grep()，agrep()等等，但没有成功…

subset(dat,grepl("ADN",bName)  &  pName == "2011-02-10_R2" )

注“&” (而不是向量化的“&&”)和“==”(而不是“=”这是赋值)。

请注意，您可以使用：

dat[ with(dat,bName)  &  pName == "2011-02-10_R2" ),]

…并且在内部函数中使用时可能会更为可取，但是将返回dat $ pName为NA的任何行的NA值。该缺陷(某些视为特征)可以通过添加& ！is.na(dat $ pName)到逻辑表达式。

（编辑：李大同）

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