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正则表达式 – 通过匹配模式用另一个文本文件中的行替换字符串

发布时间:2020-12-14 06:04:09 所属栏目:百科 来源:网络整理
导读:我有一个带通信密钥的文件 – 值: sort keyFile.txt | headENSMUSG00000000001 ENSMUSG00000000001_Gnai3ENSMUSG00000000003 ENSMUSG00000000003_PbsnENSMUSG00000000003 ENSMUSG00000000003_PbsnENSMUSG00000000028 ENSMUSG00000000028_Cdc45ENSMUSG000000
我有一个带通信密钥的文件 – >值:

sort keyFile.txt | head
ENSMUSG00000000001  ENSMUSG00000000001_Gnai3
ENSMUSG00000000003  ENSMUSG00000000003_Pbsn
ENSMUSG00000000003  ENSMUSG00000000003_Pbsn
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000028  ENSMUSG00000000028_Cdc45
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19
ENSMUSG00000000031  ENSMUSG00000000031_H19

我想用temp.txt中的“value”替换“key”的每个对应关系:

head temp.txt
ENSMUSG00000000001:001  515
ENSMUSG00000000001:002  108
ENSMUSG00000000001:003  64
ENSMUSG00000000001:004  45
ENSMUSG00000000001:005  58
ENSMUSG00000000001:006  63
ENSMUSG00000000001:007  46
ENSMUSG00000000001:008  11
ENSMUSG00000000001:009  13
ENSMUSG00000000003:001  0

结果应该是:

out.txt
ENSMUSG00000000001_Gnai3:001    515
ENSMUSG00000000001_Gnai3:002    108
ENSMUSG00000000001_Gnai3:003    64
ENSMUSG00000000001_Gnai3:004    45
ENSMUSG00000000001_Gnai3:005    58
ENSMUSG00000000001_Gnai3:006    63
ENSMUSG00000000001_Gnai3:007    46
ENSMUSG00000000001_Gnai3:008    11
ENSMUSG00000000001_Gnai3:009    13
ENSMUSG00000000001_Gnai3:001    0

我在this AWK example之后尝试了一些变化但是你可以看到结果不是我的预期:

awk 'NR==FNR{a[$1]=$1;next}{$1=a[$1];}1' keyFile.txt temp.txt | head
 515
 108
 64
 45
 58
 63
 46
 11
 13
 0

我的猜测是temp的第1列与keyValues的’确切’第1列不匹配.有人可以帮我这个吗?

R / python / sed解决方案也很受欢迎.

解决方法

像这样使用awk命令:

awk 'NR==FNR {a[$1]=$2;next} {
   split($1,b,":");
   if (b[1] in a)
       print a[b[1]] ":" b[2],$2;
   else
       print $0;
 }' keyFile.txt temp.txt

(编辑:李大同)

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